Postdocs

Sneha Mishra

Controlling pervasive transcription during neuronal differentiation

Postdoc
Aarhus University

Sneha Mishra, Afdeling for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet, har af Lundbeckfonden modtaget en LF Postdoc forskningsbevilling på 2.400.000 kr.

Om projektet

Hvordan celler ’bestemmer’, hvilke RNA'er der skal nedbrydes i forhold til, hvilke der skal forberedes til funktionelle opgaver, er et ubesvaret spørgsmål inden for molekylærbiologien.

Nye data fra Sneha Mishras  værtslaboratorium tyder på, at ikke-produktiv forekomst af transkriptioner falder sammen med lave niveauer af påbegyndte transkriptioner; dvs. beskedent transskriberede RNA'er ser ud til at være mere modtagelige for tidligt at blive bragt til ende.

For at teste den universelle karakter af en sådan regulering vil Sneha Mishra i dette projekt bruge et nyligt rapporteret mismatch guide RNA/CRISPR-dCas9 system til at manipulere initieringsniveauer for transkription af udvalgte loci og herved etablere et justerbart system til at analysere skæbnen for RNA'er udtrykt fra svagere vs. stærkere promotorer.

Ved hjælp af dette system vil Sneha Mishra undersøge den underliggende mekanisme og rationalisere, hvordan celler kontrollerer falsk transkription. Integrator-komplekset (INT) og ARS2-proteinet er impliceret i en sådan tidlig transkriptions-terminering, hvilket er interessant for den neurobiologiske videnskab, da mutationer i INT-underenheder og i ARS2 er rapporteret i neurologiske sygdomme.

Hendes resultater vil dechifrere den funktionelle implikation af INT og ARS2 i at kontrollere pervasiv transkription under neuronal differentiering, hvilket kan bane vejen for fremtidig behandling.

Sneha Mishra