Lotte Stagsted
Regulatory roles of 3D chromatin topology in alternative splicing and circular RNA biogenesis
Lotte Stagsted, Afdeling for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet, har af Lundbeckfonden modtaget en LF Postdoc forskningsbevilling på 2.620.672 kr.
Om projektet
Lotte Stagsted vil undersøge, hvordan tilpasning i kromatin 3D-topologi som reaktion på ændringer i geners udtryk bidrager til reguleringen af specifikke RNA-processer, såsom biogenesen af cirkulære RNA'er, der er overrepræsenteret i neuroner. Hun vil belyse virkningen af 'smeltning' af lange gener på RNA i nerveceller (neuroner).
'Smeltning' er et nyligt opdaget træk ved kromatinregulering i post-mitotiske pattedyrceller, der ofte findes i neuronale gener i forbindelse med topoisomerase-følsomhed, som igen er forbundet med neuroudviklingsmæssige og neurodegenerative lidelser. For at udforske 3D-foldning af lange neuronale gener og kortlægge in situ RNA-behandlings parallelt med genomarkitekturkortlægning fra de samme celler, vil projektet drage fordel af nye teknologier og biologiske systemer, der er unikt tilgængelige i et internationalt samarbejde. Resultaterne vil åbne nye veje til karakterisering af molekylære mekanismer for deregulering af genudtrykket på niveauet af transkription til forskellige output.
